در این کتاب بیماری های گیاهان در دو گروه مسری و غیر مسری معرفی شده اند. در جلد اول قارچ نماها و قارچها و در جلد دوم پروکاریوت ها، ویروس و ویروئیدها، نماتودها و گیاهان گلدار انگل و نیمه انگل و همچنین عوارض ناشی از کمبود عناصر غذایی و محیطی شرح داده شده اند.
چاپ دوم کتاب قارچ و بیماری شناسی گیاهی در سال 1377 به عنوان کتاب نمونه سال برگزیده شد.
شایان ذکر است کتب تألیفی دکتر الهی نیا که تاکنون توسط انتشارات دانشگاه گیلان به چاپ رسیده اند عبارتند از:
1- کتاب «قارچ و بیماری شناسی گیاهی» چاپ اول 1372، چاپ چهارم 1393.
2- کتاب «بیماری شناسی و شناخت قارچ ها و سایر عوامل بیماری زا در گیاهان»، چاپ اول 1382، چاپ سوم 1387.
3- کتاب «بیماری درختان میوه و برخی از گیاهان باغی و روش مبارزه با آنها»، چاپ اول 1383 ، چاپ سوم 1391.
4- کتاب «بیماری سبزی و صیفی و روش های مبارزه با آنها» ، چاپ اول 1383 ،چاپ دوم 1387.
5- کتاب «بیماری های گیاهان زراعی و روش های مبارزه با آنها»، چاپ اول 1384 ، چاپ دوم 1388.