Shahrokh Ghovvati

Journal Paper

1. "Genome-wide scanning for candidate lethal genes associated with early embryonic mortality in Holstein dairy cattle"
   1- سمیه رضائی 2- عبدالاحد شاد پرور 3- حسن بانه 4- شاهرخ قوتی
   Frontiers in Animal Science, 2025
2. "Influence of LED light spectra and photoperiods on performance, bone characteristics and related genes expression in broiler breeders"
   1- ندا نصیرزاده 2- محمد جواد ضمیری 3- امیر اخلاقی 4- شاهرخ قوتی 5- شهریار کارگر 6- جواد امینی
   BRITISH POULTRY SCIENCE, 2024
3. "Comparative study of gene expression and allele-specific expression in three tissues of the heart, muscle, and spleen of roosters adapted to low and high altitude regions based on open access RNA-Seq databases"
   1- مینا سلیم پور 2- ضياءالدين میرحسینی 3- محمد حسین بناءبازی 4- شاهرخ قوتی 5- مجید خان سفید
   Animal Production Research, 2024
4. "Unraveling the H5N1 Influenza Infection Response: A Comparative Gene Expression Networks and Functionally Enriched Pathways Analysis in Chickens and Ducks"
   1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی 3- زهرا پزشکیان
   Animal Production Research, 2024
5. "Influence of LED light spectra and photoperiods on broiler breeders production, reproduction, blood metabolites, immunological response, and hepatic sterol regulatory element binding protein-1 (SREBP1) relative gene expression"
   1- ندا نصیرزاده 2- محمد جواد ضمیری 3- امیر اخلاقی 4- شاهرخ قوتی 5- شهریار کارگر 6- جواد امینی
   Journal of Livestock Science and Technologies, 2023
6. "Bioinformatics and Pathway Enrichment Analysis Identified Hub Genes and Potential Biomarker for Gastric Cancer Prognosis"
   1- الهام دارنگ 2- زهرا پزشکیان 3- ضياءالدين میرحسینی 4- شاهرخ قوتی
   Frontiers in Oncology, 2023
7. "Engineering Human Pancreatic RNase 1 as an Immunotherapeutic Agent for Cancer Therapy Through Computational and Experimental Studies"
   1- محمد رضا نصیری 2- شاهرخ قوتی 3- مرضیه قارونی 4- مجتبی طهمورث پور 5- احمد رضا بهرامی 6- حسام دهقانی
   PROTEIN JOURNAL, 2023
8. "Signaling Roadmap Modulating Chicken Primordial Germ Cells Proliferation and Self‐Renewal"
   1- معصومه زارع 2- ضياءالدين میرحسینی 3- سیده نفیسه حسنی 4- شاهرخ قوتی
   Iranian Journal of Applied Animal Science, 2023
9. "Phenotypic evaluation of feed efficiency, growth and carcass traits in native turkeys"
   1- زهرا پزشکیان 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی 4- اسماعیل ابراهیمی
   Journal of Central European Agriculture, 2023
10. "The constitutively active pSMAD2/3 relatively improves the proliferation of chicken primordial germ cells"
    1- معصومه زارع 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی 4- سعید یخکشی 5- مهدی حصارکی 6- مژگان براتی 7- فروغ سیاح پور 8- حسین بهاروند 9- سیده نفیسه حسنی
    MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT, 2023
11. "The constitutively active pSMAD2/3 relatively improves the proliferation of chicken primordial germ cells"
    1- معصومه زارع 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی 4- سعید یخ کشی 5- مهدی حسارکی 6- مژگان براتی 7- فروغ اعظم سیاح پور 8- حسین بهار وند 9- سیده نفیسه حسنی
    MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT, 2023
12. "In Silico Methods for Secretory Production of a Fungal Hydrophobin (HYPAI) in Yeast to Serve as a Promising Target for Drug Delivery"
    1- حمیده دارسرایی 2- شاهرخ قوتی
    International Journal of Peptide Research and Therapeutics, 2022
13. "Genetic Diversity of Urial Population in Northeast of Iran"
    1- علی جوادمنش 2- شاهرخ قوتی 3- مهدی سلطانی 4- محمد رضا نصیری
    Iranian Journal of Animal Biosystematics, 2022
14. "Identification of Key Genes and Potential Pathways Associated with Mastitis Induced by E. coli"
    1- الهام دارنگ 2- زهرا پزشکیان 3- ضياءالدين میرحسینی 4- شاهرخ قوتی
    BIOCHEMICAL GENETICS, 2022
15. "Transcriptome Analysis of Breast Muscle Reveals Pathways Related to Protein Deposition in High Feed Efficiency of Native Turkeys"
    1- زهرا پزشکیان 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی 4- اسماعیل ابراهیمی
    Animals, 2022
16. "A meta-analysis of the gap between pedigree-based and genomic heritability estimates for production traits in dairy cows"
    1- حسن خان زاده 2- نويد قوی حسين زاده 3- شاهرخ قوتی
    Livestock Science, 2022
17. "The statistical power of genome‑wide association studies for threshold traits with different frequencies of causal variants"
    1- حسن خان زاده 2- نويد قوی حسين زاده 3- شاهرخ قوتی
    GENETICA, 2021
18. "Statistical power and heritability in whole-genome association studies for quantitative traits"
    1- حسن خان زاده 2- نويد قوی حسين زاده 3- شاهرخ قوتی
    Meta Gene, 2021
19. "Investigation of Antibiotic Resistant Coliform Bacteria in Zarjoub River"
    1- محمد باقر فرهنگی راستی 2- نسرین قربان زاده 3- میلاد امینی 4- شاهرخ قوتی
    -, 2021
20. "Production of ovine Pancreatic Ribonuclease and investigation of enzyme characteristics"
    1- مهسا ضابطیان 2- محمدرضا نصیري 3- علی جوادمنش 4- شاهرخ قوتی
    -, 2021
21. "VEGF-C and p53 Gene Expression in the Normal and Neoplastic Mammary Gland of Canines: A Pilot Study"
    1- محمد رضا نصیری 2- آزاده صفرچی 3- معصومه وکیلی 4- وینود گوپالان 5- محمد دوستی 6- شاهرخ قوتی 7- احمد رضا موثقی
    Journal of Cell and Molecular Research, 2021
22. "Identification of hub genes involved in apparent metabolizable energy of chickens"
    1- زهرا پزشکیان 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی
    Animal Biotechnology, 2020
23. "Genome Wide Association Studies, Next Generation Sequencing and Their Application in Animal Breeding and Genetics: A Review"
    1- حسن خان زاده 2- نويد قوی حسين زاده 3- شاهرخ قوتی
    Iranian Journal of Applied Animal Science, 2020
24. "A Comprehensive Phylogenetic and Bioinformatics Assessment of Hydrophobin Protein (HYPAI) for Drug Delivery: an In Silico Analysis"
    1- حمیده دارسرایی 2- شاهرخ قوتی 3- سيد اکبر خداپرست
    International Journal of Peptide Research and Therapeutics, 2020
25. "Designing of Protein Structural of Ranpirnase Based on Bovine Pancreatic Ribonuclease with Using Molecular Dynamic and Static Simulation"
    1- حمید آریان نژاد 2- محمدرضا نصیری 3- علی جوادمنش 4- شاهرخ قوتی 5- حسام دهقانی 6- احمد آسوده
    Iranian Journal of Animal Science Research, 2020
26. "Cloning, Expression, Purification and Evaluation of the Biological Properties of the Recombinant Human Growth Hormone (hGH) in Escherichia coli"
    1- عارف دوزنده جویباری 2- شاهرخ قوتی 3- حميد رضا وزيری 4- محمد مهدی سوهانی
    International Journal of Peptide Research and Therapeutics, 2019
27. "Production and introduction of a novel immunotoxin basedon engineered RNase A for inducing death to Her1‐positive cell lines"
    1- علی فروهرمهر 2- محمدرضا نصیری 3- شاهرخ قوتی 4- علی جوادمنش
    Journal of cellular physiology, 2019
28. "Evaluation of Different Signal Peptides Using Bioinformatics Tools to Express Recombinant Erythropoietin in Mammalian Cells"
    1- فرید واحدی 2- محمدرضا نصیری 3- شاهرخ قوتی 4- علی جوادمنش
    International Journal of Peptide Research and Therapeutics, 2018
29. "Evaluation of Different Signal Peptides for Secretory Production of Recombinant Bovine Pancreatic Ribonuclease A in Gram Negative Bacterial System: An In silico Study"
    1- علی فروهر مهر 2- محمدرضا نصیری 3- شاهرخ قوتی 4- علی جوادمنش
    Current Proteomics, 2018
30. "Investigation of allelic frequency and forensic genetics parameter for 10 STR loci in Arab and Kurd ethnics of Iran"
    1- محمدرضا نصیری 2- شاهرخ قوتی 3- ضياءالدين میرحسینی 4- علی جوادمنش 5- مرتضی مهدوی 6- آرش علیپور 7- معصومه وکیلی ازغندی
    Journal of Birjand University of Medical Sciences, 2018
31. "In silico analysis of different signal peptides to discover a panel of appropriate signal peptides for secretory production of Interferon-beta 1b in Escherichia coli"
    1- شاهرخ قوتی 2- زهرا پزشکیان 3- ضياءالدين میرحسینی
    Acta Biochimica Polonica, 2018
32. "Evaluation of Estrogen Receptor a and B Genes Expression in Normal and Neoplastic Mammary Gland in Dogs by Real-time PCR"
    1- محمدرضا نصیری 2- آرزو حسینی 3- شاهرخ قوتی 4- مهسا ضابطیان
    Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine, 2018
33. "Phylogenetic and In Silico Analysis of Interferon Beta-1b Protein"
    1- ضياءالدين میرحسینی 2- زهرا پزشکیان 3- شاهرخ قوتی
    Journal of Mazandaran University of Medical Sciences, 2017
34. "A Comprehensive Bioinformatic Assessment of Different Signal Peptides for Secretory Expression of Human Growth Hormone in Escherichia Coli: An In Silico Study"
    1- عارف دوزنده جویباری 2- حميد رضا وزيری 3- شاهرخ قوتی 4- محمد مهدی سوهانی
    Journal of Isfahan Medical School, 2017
35. "Evaluation of different statistical methods using SAS software: an in silico approach for analysis of real-time PCR data"
    1- محمد رضا نصیری 2- مهدی الهی 3- شاهرخ قوتی 4- محمد دوستی
    JOURNAL OF APPLIED STATISTICS, 2017
36. "Evaluation of the effect of growth factor Activin A and small molecule IDE1 on the proliferation and self-renewal of cells Primitive chick embryo in laboratory culture conditions"
    1- معصومه زارع 2- ضياءالدين میرحسینی 3- سیده نفیسه حسنی 4- شاهرخ قوتی
    زیست شناسی کاربردی, 2023
37. "Expression of serine biosynthesis pathway genes in breast muscles of Iranian native turkeys with divergent feed efficiency"
    1- زهرا پزشکیان 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی 4- اسماعیل ابراهیمی
    پژوهش های علوم دامی ایران, 2022
38. "Ribonucleases as potential therapeutic agents"
    1- معصومه وکیلی 2- محمد رضا نصیری 3- شاهرخ قوتی 4- علی جوادمنش
    بیوتکنولوژی کشاورزی, 2021

Conference Paper

1. "Bioinformatic investigation and analysis of Myoz2 protein network in poultry"
   1- محدثه آزرمند 2- شاهرخ قوتی 3- نويد قوی حسين زاده
   بیست و سومین کنگره ملی و یازدهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران,
2. "Transcriptomic Analysis and Investigation of Biological Networks of NSCLC Lung Cancer or non-small cell lung cancer"
   1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
   بیست و سومین کنگره ملی و یازدهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران,
3. "Investigating and Predicting the Structure of Bacterial Keratinase Enzyme Using Artificial Intelligence Based on Deep Learning Model"
   1- زهرا مجیدی 2- عبدالاحد شاد پرور 3- شاهرخ قوتی
   بیست و سومین کنگره ملی و یازدهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران,
4. "Identification of the differentially expressed genes in jejunum compared to ileum tissue of the intestine of Iranian native turkeys using RNA-seq technique"
   1- الهام دارنگ 2- ضياءالدين میرحسینی 3- شاهرخ قوتی 4- مجید خان سفید
   سومین کنفرانس بین المللی فناوری های نوین در علوم,
5. "Analysis of microarray data to identify key genes involved in female lung cancer: a meta-analysis approach"
   1- فاطمه جعفری 2- عبدالاحد شاد پرور 3- شاهرخ قوتی
   سومین کنفرانس بین المللی فناوری های نوین در علوم,
6. "Comparative analysis of microarray data to detect differentiation between two prostate cancer cell lines: an approach to introduce potential biomarkers"
   1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
   سومین کنفرانس بین المللی فناوری های نوین در علوم,
7. "Revealing the role of the main genes VCL, MYLK and TPM1 in prostate cancer in data mining and analysis of benign and cancerous microarrays"
   1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
   سومین کنفرانس بین المللی فناوری های نوین در علوم,
8. "Spleen Lymphocyte Proliferation Assay in Chickens Vaccinated with Irradiated H9N2 Avian Influenza Vaccine"
   1- سوگند شایسته 2- فرحناز معتمدی 3- شاهرخ قوتی 4- ناصر فرخی
   دهمین کنگره ملی و دومین کنگره بین المللی علوم دامی ایران,
9. "Influence of LED light spectra and photoperiods on mineralization and characteristics of bone in broiler breeders"
   1- ندا نصیرزاده 2- محمد جواد ضمیری 3- امیر اخلاقی 4- شاهرخ قوتی 5- شهریار کارگر 6- جواد امینی
   دهمین کنگره ملی و دومین کنگره بین المللی علوم دامی ایران,
10. "Effect of replacement of soy bean meal with black soldier fly larvae powder (defatted) and grasshopper powder on carcass characteristics and internal organs that related to immune system in Arian strain broiler chickens"
    1- علی ریعان محصصی 2- حسن درمانی کوهی 3- اردشير محيط 4- شاهرخ قوتی 5- جواد امینی
    دهمین کنگره ملی و دومین کنگره بین المللی علوم دامی ایران,
11. "Effect of replacing black soldier fly larvae powder (defatted) and grasshopper powder with soybean meal on on growth performance and some of blood metabolites related to fat meabolsm in Arian strain broilers"
    1- علی ریعان محصصی 2- حسن درمانی کوهی 3- اردشير محيط 4- شاهرخ قوتی
    دهمین کنگره ملی و دومین کنگره بین المللی علوم دامی ایران,
12. "Phylogenetic analysis and bioinformatic evaluation of FBAT4 Protein in bos taurus"
    1- محدثه آزرمند 2- ساره گل پسند 3- شاهرخ قوتی
    دهمین کنگره ملی و دومین کنگره بین المللی علوم دامی ایران,
13. "Integrated bioinformatics analysis revealed that hub genes correlated with the prognosis and pathogenesis of gastric cancer"
    1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
    دومین همایش بین المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران,
14. "Phylogenetic and structural analysis of native avian influenza subtype H9N2 hemagglutinin isolated"
    1- سوگند شایسته 2- ناصر فرخی 3- فرحناز معتمدی سده 4- شاهرخ قوتی
    دومین همایش بین المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران,
15. "Comprehensive bioinformatics analysis for Identification of Potential Crucial Genes and Key Pathways in Early Diagnosis of Gastric Cancer: Helicobacter pylori (Follicular gastritis) Induced Chronic Gastritis with Increasing Risk of Gastric Cancer"
    1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
    دومین همایش بین المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران,
16. "Gene network analysis and identification of functionally enriched pathways of response to H5N1-5092 influenza infection in chickens"
    1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی 3- زهرا پزشکیان
    دهمین کنگره ملی و دومین کنگره بین المللی علوم دامی ایران,
17. "Comparative evaluation of NCF2 gene expression in the breast muscle of indigenous Iranian male turkeys with different feed efficiency"
    1- مهدی معززلسکو 2- شاهرخ قوتی 3- ضياءالدين میرحسینی 4- نويد قوی حسين زاده
    سومین کنفرانس بین المللی فناوری های نوین در علوم,
18. "Phylogenetic and bioinformatics analysis of human Apolipoprotein E (APOE)"
    1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
    بیست و دومین کنگره ملی و دهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران,
19. "Investigation of the evolutionary relationship and bioinformatics of tumor necrosis factor (TNF)"
    1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
    بیست و دومین کنگره ملی و دهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران,
20. "In silico and protein network analysis of tumor necrosis factor (TNF)"
    1- ساره گل پسند 2- شاهرخ قوتی
    بیست و دومین کنگره ملی و دهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران,